11番札所藤井寺(ふじいでら)は、臨済宗妙心寺派に属しています。
四国八十八ヶ所は、全部が真言宗というわけではなく、天台宗が四寺、臨済宗が二寺、曹洞宗が一寺、時宗も一寺あります。
天正年間(西暦1573年~1592年)この寺は、土佐の大名である長曽我部元親により焼き打ちされ、また天保三年(西暦1832年)の大火でも伽藍が焼けましたが、国宝となっている薬師如来像だけは、2回の火災にも焼失することなく今でも奥殿に安置されています。
四国各地の礼拝所を焼き払った長曽我部家は、関ヶ原の戦いでは傍観したまま、なすすべもなく敗退し滅亡しました。
藤井寺の公式ホームページです。
http://www.88shikokuhenro.jp/tokushima/11fujiidera/